Glavni Novice V oceanu so odkrili na tisoče novih virusov

V oceanu so odkrili na tisoče novih virusov

Ilustracija torovirusa, vrste virusa RNA.

(Zasluge za sliko: Nanoclustering/Getty Images)

Po novi študiji je bilo v svetovnih oceanih odkritih več kot 5000 novih vrst virusov.

Raziskovalci študije so analizirali na desettisoče vzorcev vode z vsega sveta in lovili viruse RNA ali viruse, ki uporabljajoRNAkot njihov genetski material. Novi koronavirus je na primer vrsta virusa RNA. Ti virusi so premalo raziskani v primerjavi z virusi DNA, ki uporabljajo DNK kot njihov genetski material, so povedali avtorji.

Raznolikost novoodkritih virusov je bila tako velika, da so raziskovalci predlagali podvojitev števila taksonomskih skupin, potrebnih za razvrščanje virusov RNA, z obstoječih petih na 10 tipov. (Deblo je široka klasifikacija v biologiji tik pod 'kraljestvom'.)

'Tukaj je toliko nove raznolikosti – in celotno [novo] deblo, Taraviricota, so našli povsod po oceanih, kar nakazuje, da so ekološko pomembni,' je vodilni avtor študije Matthew Sullivan, profesor mikrobiologije na Državni univerzi Ohio , je dejal v izjavi (odpre se v novem zavihku).

Sorodno: Najbolj smrtonosni virusi v zgodovini

Študije virusov RNA so se običajno osredotočale na tiste, ki povzročajo bolezni, pravi Sullivan. (Nekateri dobro znani virusi RNA vključujejo gripo, ebolo in koronavirus, ki povzroča COVID-19.) Toda to je le 'majhna rezina' virusov RNA na Zemlji, je dejal Sullivan.

'Želeli smo jih sistematično preučiti v zelo velikem obsegu in raziskati okolje, ki ga nihče ni podrobno pogledal,' je dejal Sullivan v izjavi.

Za študijo, objavljeno v četrtek (7. aprila) v reviji Znanost (odpre se v novem zavihku), so raziskovalci analizirali 35.000 vzorcev vode, vzetih s 121 lokacij v vseh petih svetovnih oceanih. Raziskovalci so del konzorcija Tara Oceans, globalnega projekta za preučevanje vpliva sprememba podnebja na oceanu.

Preučevali so genetska zaporedja, ekstrahirana iz majhnih vodnih organizmov, znanih kot plankton, ki so običajni gostitelji virusov RNA, so povedali raziskovalci. Ugotovili so zaporedja, ki pripadajo virusom RNA, tako da so iskali starodavni gen, imenovan RdRp, ki ga najdemo v vseh virusih RNA, vendar ga v drugih virusih in celicah ni. Identificirali so več kot 44.000 sekvenc s tem genom.

Toda gen RdRp je star milijarde let in se je večkrat razvil. Ker evolucija gena sega tako daleč nazaj, je bilo raziskovalcem težko določiti evolucijsko razmerje med zaporedji. Zato so raziskovalci uporabili strojno učenje, da bi jih organizirali.

Na splošno so identificirali približno 5500 novih vrst virusov RNK, ki so spadale v pet obstoječih vrst, kot tudi pet na novo predlaganih vrst, ki so jih raziskovalci poimenovali Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota in Arctiviricota.

Virusne vrste v deblu Taraviricota so bile še posebej bogate v zmernih in tropskih vodah, medtem ko so virusi v deblu Arctiviricota v izobilju v Arktičnem oceanu, so zapisali raziskovalci v Pogovor. (odpre se v novem zavihku)

Razumevanje, kako se je gen RdRp sčasoma razšel, bi lahko pripeljalo do boljšega razumevanja, kako se je razvilo zgodnje življenje Zemlja , so povedali avtorji.

'RdRp naj bi bil eden najstarejših genov - obstajal je, preden je bila potreba po DNK,' je v izjavi dejal soavtor študije Ahmed Zayed, mikrobiološki raziskovalec v državi Ohio. 'Torej ne iščemo le izvora virusov, ampak tudi izvora življenja.'

Prvotno objavljeno na Live Science.

Zanimivi Članki